Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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