Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Myod1P10085 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms