Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtaP09225 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtaP09225 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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