Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Hoxa5P09021 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms