Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

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Length 1,416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BlmO88700 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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BlmO88700 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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BlmO88700 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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BlmO88700 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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BlmO88700 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BlmO88700 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BlmO88700 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BlmO88700 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BlmO88700 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BlmO88700 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BlmO88700 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BlmO88700 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BlmO88700 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BlmO88700 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BlmO88700 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BlmO88700 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BlmO88700 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BlmO88700 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BlmO88700 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BlmO88700 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms