Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms