Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms