Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms