Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms