Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh16O54909 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms