Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DffaO54786 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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DffaO54786 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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DffaO54786 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DffaO54786 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms