Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NmiO35309 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NmiO35309 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms