Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnk3O35111 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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Kcnk3O35111 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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Kcnk3O35111 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Kcnk3O35111 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Kcnk3O35111 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcnk3O35111 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms