Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac1O09106 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdac1O09106 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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