Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EllO08856 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EllO08856 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
EllO08856 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EllO08856 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EllO08856 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EllO08856 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
EllO08856 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
EllO08856 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
EllO08856 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
EllO08856 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
EllO08856 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
EllO08856 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
EllO08856 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
EllO08856 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
EllO08856 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
EllO08856 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
EllO08856 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
EllO08856 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms