Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms