Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Gm20939L7N243 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Gm20939L7N243 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20939L7N243 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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