Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
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Ccdc180J3QNE4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms