Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
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