Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gm21818J3KMS6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gm21818J3KMS6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gm21818J3KMS6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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