Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21411J3KMS0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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