Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms