Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubap1lG3UW59 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubap1lG3UW59 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms