Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScaperF8VQ70 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms