Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
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