Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8220F6YKI2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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