Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm340F6RGI3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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