Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd1E9PZ26 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd1E9PZ26 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms