Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms