Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms