Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cttnbp2B9EJA2 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms