Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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