Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Olfr46-202ENSMUST00000211771 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apba1B2RUJ5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms