Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms