Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms