Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PtprsB0V2N1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PtprsB0V2N1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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PtprsB0V2N1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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PtprsB0V2N1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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PtprsB0V2N1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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PtprsB0V2N1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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PtprsB0V2N1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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PtprsB0V2N1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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PtprsB0V2N1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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PtprsB0V2N1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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PtprsB0V2N1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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