Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms