Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms