Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms