Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms