Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ripk3Q9QZL0 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ripk3Q9QZL0 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms