Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms