Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms