Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dclk1Q9JLM8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dclk1Q9JLM8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dclk1Q9JLM8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dclk1Q9JLM8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dclk1Q9JLM8 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dclk1Q9JLM8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dclk1Q9JLM8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dclk1Q9JLM8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dclk1Q9JLM8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dclk1Q9JLM8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dclk1Q9JLM8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms