Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms