Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3m1Q9JKC8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms