Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms