Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.8 ms