Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL4

Pdzk1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1Q9JIL4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pdzk1Q9JIL4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pdzk1Q9JIL4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pdzk1Q9JIL4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pdzk1Q9JIL4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pdzk1Q9JIL4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdzk1Q9JIL4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pdzk1Q9JIL4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1Q9JIL4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1Q9JIL4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1Q9JIL4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1Q9JIL4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1Q9JIL4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pdzk1Q9JIL4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pdzk1Q9JIL4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pdzk1Q9JIL4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1Q9JIL4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1Q9JIL4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1Q9JIL4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1Q9JIL4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1Q9JIL4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1Q9JIL4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1Q9JIL4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1Q9JIL4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1Q9JIL4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1Q9JIL4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1Q9JIL4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1Q9JIL4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdzk1Q9JIL4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms