Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Trim39Q9ESN2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Trim39Q9ESN2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Trim39Q9ESN2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Trim39Q9ESN2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Trim39Q9ESN2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Trim39Q9ESN2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Trim39Q9ESN2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Trim39Q9ESN2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Trim39Q9ESN2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim39Q9ESN2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim39Q9ESN2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim39Q9ESN2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Trim39Q9ESN2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim39Q9ESN2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Trim39Q9ESN2 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim39Q9ESN2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Trim39Q9ESN2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim39Q9ESN2 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim39Q9ESN2 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim39Q9ESN2 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim39Q9ESN2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim39Q9ESN2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim39Q9ESN2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim39Q9ESN2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim39Q9ESN2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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